La cooperación andino-europea ha evolucionado con el tiempo. En su primera etapa (1973 - 1982), estuvo orientada a impulsar acciones en diferentes sectores tales como: desarrollo agropecuario, cooperación energética y agricultura. En la segunda etapa (1983 - 1992), iniciada con la firma del acuerdo de cooperación de "segunda generación", se enfatizaron asuntos de la cooperación económica y comercial. La tercera etapa (1993 - 2003), destacada por la suscripción de un Acuerdo de Cooperación de "tercera generación", incorporó elementos vinculados con el desarrollo político y social. Durante los últimos años, la profundización de las relaciones de cooperación entre la Comunidad Andina (CAN) y la Unión Europea (UE), ha contribuido al fortalecimiento de la integración andina y por consiguiente a la paz y al desarrollo económico y social de la región.

La cooperación internacional para el desarrollo ha permitido consolidar aún más estas relaciones, así como impulsar y afianzar el proceso andino de integración en sus distintos ámbitos a través de los programas plurianuales implementados en apoyo a la integración andina, a partir del año 2000. De esta manera, la Comisión Europea aprobó la primera Estrategia de Cooperación Regional con la Comunidad Andina para el período 2002-2006, asignando un total de 29.4 millones de euros para proyectos en los sectores de prevención de desastres, asistencia técnica relativa al comercio, estadísticas, sociedad civil y drogas sintéticas. Posteriormente, la Comisión aprobó la segunda Estrategia de Cooperación Regional con la Comunidad Andina para el período 2007-2013, asignando 50 millones de euros, orientados a proyectos en los sectores de integración económica regional, cohesión económica y social, lucha contra las drogas ilícitas, y protección del medio ambiente y cambio climático.